13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3648 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  31.17 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  32.5 
 
 		 161 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  31.52 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.31 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  32.67 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  34.85 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.7 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  34.15 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  26.74 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  35.48 
 
 		 546 aa  42.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  26.32 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>