34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1750 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  95.67 
 
 		 231 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  45.87 
 
 		 229 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  32.28 
 
 		 362 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  38.32 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  38.89 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  41.18 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  29.77 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  36.84 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  29.27 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  36.19 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  32.98 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  34.52 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  29.82 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  30.51 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  35.71 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  23.39 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  23.29 
 
 		 369 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  29.2 
 
 		 122 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  28.3 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  32.56 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  28.24 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  31.31 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  22.54 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  28.24 
 
 		 1626 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  23.53 
 
 		 607 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  32.67 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  27.94 
 
 		 347 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3875  hypothetical protein  42.5 
 
 		 89 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0338911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>