34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2548 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  36.89 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  34.68 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  36.44 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  31.84 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  32.37 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  39.06 
 
 		 140 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  26.03 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  38.28 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  43.43 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  39.62 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  39 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  34.88 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  38.3 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  45.45 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  35.14 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  35.58 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  35 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  37.35 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  42.7 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  38.46 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.31 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  34.65 
 
 		 130 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  34.04 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  27.43 
 
 		 383 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  32.63 
 
 		 145 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3060  hypothetical protein  27.33 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  28.43 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  31.78 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  22.66 
 
 		 369 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  26.87 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  26.52 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  25.59 
 
 		 2690 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  31.82 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>