28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1647 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  64.71 
 
 
133 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  43.41 
 
 
150 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  42.19 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  42.34 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  45.36 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  36.96 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  38.78 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  43.21 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  35.35 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  43.37 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  37.7 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  41.98 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  34.38 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  31.97 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  31.16 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  31.37 
 
 
362 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  32.48 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6643  hypothetical protein  26.96 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  33.33 
 
 
347 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  30.77 
 
 
229 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  27.55 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  31.78 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  26.98 
 
 
388 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  28.28 
 
 
231 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>