31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2663 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  263  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  42.31 
 
 
161 aa  90.1  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  50.57 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  46.07 
 
 
150 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  38.76 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  45.65 
 
 
158 aa  84  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  37.69 
 
 
231 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  45.88 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  43.02 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  38.32 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  42.22 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  38.32 
 
 
231 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  37.23 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  33.08 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  35.66 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  36.28 
 
 
229 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  36.7 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  36.17 
 
 
362 aa  70.5  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  36.84 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  35.85 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  38.37 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  31.97 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  31.71 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  31.68 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  30.86 
 
 
347 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  35.44 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0508  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2339  hypothetical protein  43.9 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000254701  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>