31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1993 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  47.25 
 
 		 161 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  26.03 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  40 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  39.53 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  42.06 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  38.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  27.51 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  38.68 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  25.68 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  36.44 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  37.7 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  36.89 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  38.55 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  37.76 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  25.91 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  38.82 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  24.31 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  28.86 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  23.39 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  34.51 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  36.36 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  29.75 
 
 		 130 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  24.91 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  34.12 
 
 		 138 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  29.38 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  31.09 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>