32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0319 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  290  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  51.65 
 
 
362 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  44.44 
 
 
150 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  49 
 
 
158 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  37.96 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  41.03 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  40.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  44.04 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  46.09 
 
 
140 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  44.57 
 
 
150 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  45.31 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  37.69 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  39.53 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  34.48 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  44.09 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  36 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  33.59 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  32.86 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  29.77 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  36.88 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  39.39 
 
 
231 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  32.03 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  36.75 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  34.35 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  32.35 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  26.76 
 
 
388 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  35.29 
 
 
347 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  34.31 
 
 
383 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  28.87 
 
 
1428 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  22.06 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>