32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6328 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  47.41 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  53 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  37.5 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  41.04 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  46.09 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  42.73 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  44.57 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  50.57 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  41.18 
 
 		 362 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  37.74 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  43.33 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  40.7 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  39 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  43.33 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  35.97 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  36.08 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  43.37 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  39.17 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  38.27 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  36.84 
 
 		 231 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  37.04 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  35.63 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  34.78 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  30.28 
 
 		 388 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  29.71 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  28.57 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  32.95 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  34.85 
 
 		 285 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.69 
 
 		 759 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  27.85 
 
 		 268 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>