28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4968 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  51.04 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  45.83 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  42.86 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  38.41 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  45.36 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  42.31 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  34.58 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  35.05 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  37.76 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  29.63 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  34.21 
 
 
362 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  32.32 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  34.31 
 
 
229 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  37.04 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  36.78 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  29.71 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  35.87 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  31.68 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  35.29 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  30.56 
 
 
231 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  28.43 
 
 
240 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  30.39 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  28.7 
 
 
231 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  29.71 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  31.58 
 
 
388 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>