28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1003 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  790    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  25.69 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  31.96 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  29.31 
 
 
240 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  29.25 
 
 
231 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  30.39 
 
 
140 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  30.28 
 
 
150 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  28.86 
 
 
270 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  29.51 
 
 
130 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  29.7 
 
 
158 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  32.95 
 
 
153 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  25.62 
 
 
130 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  23.33 
 
 
155 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  30.83 
 
 
150 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  29.52 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  24.39 
 
 
147 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  28.57 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  30.08 
 
 
131 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  29.89 
 
 
131 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  29.52 
 
 
145 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  29.29 
 
 
122 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6643  hypothetical protein  29.23 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  27.88 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  26.98 
 
 
130 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  24.03 
 
 
133 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>