32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1402 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 
153 aa  313  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  37.5 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  40.15 
 
 
147 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  41.22 
 
 
158 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  38.67 
 
 
155 aa  97.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  33.77 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  40.78 
 
 
150 aa  87  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  41.28 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  43.96 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  42.34 
 
 
229 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  40.38 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  37.86 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  39.09 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  40.71 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  41.3 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  41.18 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  30.2 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  37.62 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  45.45 
 
 
240 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  35.78 
 
 
229 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  36.89 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  36 
 
 
270 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  32.95 
 
 
388 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  37.63 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  28 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  28.79 
 
 
369 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  26.56 
 
 
347 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  24.55 
 
 
285 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>