35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1031 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  62.17 
 
 
229 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  53.67 
 
 
229 aa  245  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  40.09 
 
 
231 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  40.09 
 
 
231 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  35.92 
 
 
240 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  39.2 
 
 
140 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  42.2 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  40.66 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  26.73 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  25.68 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  36.08 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  39.53 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  42.71 
 
 
153 aa  72  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  35.65 
 
 
362 aa  71.6  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  37 
 
 
150 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  38.54 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  37.08 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  27.89 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  39.39 
 
 
142 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  37.1 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.25 
 
 
388 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  28.88 
 
 
1626 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  33.33 
 
 
131 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  32.52 
 
 
130 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  35.87 
 
 
138 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  26.11 
 
 
347 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  29.08 
 
 
607 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  28.04 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  33.02 
 
 
138 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  35.14 
 
 
133 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  31.78 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
658 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>