30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4926 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  47.41 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  37.96 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  48.42 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  42.75 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  46.07 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  38.78 
 
 		 362 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  40.86 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  42.2 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  40 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  43.43 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  40.4 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  38.89 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  38.89 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  38.68 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  32.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  33.09 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  31.16 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  23.33 
 
 		 388 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  34.38 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  28.57 
 
 		 347 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  24.71 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>