29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1508 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  44.19 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  41.6 
 
 
131 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  39.23 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  40.32 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  44.35 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  40.94 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  40.88 
 
 
145 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  42.11 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  44 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  37.5 
 
 
362 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  38.78 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  32.84 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  35.05 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  37.76 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  35.79 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  32.46 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  33.67 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  46.67 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  34.78 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  29.82 
 
 
231 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  32.52 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  25.62 
 
 
388 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  32.11 
 
 
229 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  33.65 
 
 
229 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  29.75 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6643  hypothetical protein  28 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>