82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1816 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  100 
 
 		 1626 aa  3233    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  35.36 
 
 		 1544 aa  499  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.23 
 
 		 692 aa  147  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1802 aa  118  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  36.6 
 
 		 3911 aa  113  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.32 
 
 		 1272 aa  111  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  52 
 
 		 603 aa  107  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  30.38 
 
 		 1232 aa  105  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  35.27 
 
 		 1672 aa  104  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  29.01 
 
 		 1736 aa  97.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  41.83 
 
 		 1222 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  34.22 
 
 		 1236 aa  87  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  51.35 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  52.86 
 
 		 631 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.82 
 
 		 1212 aa  83.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.21 
 
 		 1192 aa  83.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  28.85 
 
 		 1029 aa  82.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.07 
 
 		 1673 aa  80.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.71 
 
 		 1394 aa  79.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  38.26 
 
 		 257 aa  77  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  25.48 
 
 		 772 aa  76.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  32.41 
 
 		 2690 aa  75.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 680 aa  75.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  29.85 
 
 		 409 aa  74.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  50 
 
 		 608 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  24.69 
 
 		 2239 aa  74.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  41.56 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  42.2 
 
 		 813 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  35.78 
 
 		 556 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  42.5 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  40.79 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 		 878 aa  68.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  33.12 
 
 		 1263 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1104 aa  67  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  40.54 
 
 		 343 aa  67  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 193 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  34.93 
 
 		 607 aa  64.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.48 
 
 		 1073 aa  64.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1590  protein of unknown function DUF1555  27.44 
 
 		 592 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.793878  normal  0.172335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1567  protein of unknown function DUF1555  27.44 
 
 		 592 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.93 
 
 		 648 aa  63.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  46.48 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  28.88 
 
 		 231 aa  61.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.13 
 
 		 2522 aa  62  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.88 
 
 		 3544 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1145 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.96 
 
 		 1129 aa  60.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  36 
 
 		 1193 aa  60.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  41.03 
 
 		 1123 aa  59.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  40.51 
 
 		 1170 aa  58.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  42.55 
 
 		 2375 aa  58.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1879 aa  58.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  38.71 
 
 		 311 aa  57  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  26.56 
 
 		 561 aa  57  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 3699 aa  56.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  23.84 
 
 		 3394 aa  56.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.32 
 
 		 3699 aa  55.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.15 
 
 		 2402 aa  53.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  31.46 
 
 		 332 aa  53.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  40.86 
 
 		 471 aa  53.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  43.94 
 
 		 618 aa  52.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  26.19 
 
 		 1313 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2777  hypothetical protein  43.08 
 
 		 169 aa  52  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  27.62 
 
 		 897 aa  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  33.88 
 
 		 968 aa  51.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.81 
 
 		 3542 aa  51.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.51 
 
 		 3563 aa  51.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.32 
 
 		 887 aa  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.2 
 
 		 1001 aa  49.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  49.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  32.38 
 
 		 1656 aa  48.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.2 
 
 		 1109 aa  46.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  32.58 
 
 		 1303 aa  46.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  44.23 
 
 		 150 aa  46.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27.65 
 
 		 5544 aa  46.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.17 
 
 		 823 aa  45.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  36.73 
 
 		 759 aa  45.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  28.24 
 
 		 231 aa  45.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  34 
 
 		 3244 aa  45.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  32.19 
 
 		 731 aa  45.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  25.43 
 
 		 756 aa  45.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>