67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1589 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 		 476 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  37.08 
 
 		 356 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  32.94 
 
 		 382 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  39.08 
 
 		 350 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  32.95 
 
 		 462 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  30.83 
 
 		 307 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1109  conserved hypothetical protein, putative cytochrome c family protein  31.37 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.594522  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  27.59 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  34.18 
 
 		 493 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  33.98 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  36.84 
 
 		 556 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  33.33 
 
 		 542 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  33.33 
 
 		 566 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  32.43 
 
 		 493 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6353  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  35.23 
 
 		 557 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  32.38 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  32.29 
 
 		 511 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  29.33 
 
 		 269 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  29.76 
 
 		 381 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.23 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  34.15 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  31.97 
 
 		 567 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 524 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 518 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 528 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 377 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 127 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  32.53 
 
 		 266 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  32.53 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 		 523 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 		 513 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  30.14 
 
 		 346 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 		 375 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 377 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 513 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  30.26 
 
 		 517 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 377 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 313 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  34 
 
 		 339 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  34 
 
 		 339 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  32.18 
 
 		 524 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  34 
 
 		 339 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 485 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  30.4 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  31.91 
 
 		 326 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 518 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  25.86 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>