42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1841 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  95.11 
 
 		 266 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  91.73 
 
 		 266 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  81.78 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  65.28 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  66.8 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  63.4 
 
 		 268 aa  337  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  63.26 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  62.98 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  64.56 
 
 		 268 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  47.74 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  49.4 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  46.57 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  47.19 
 
 		 278 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  46.04 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  46.82 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  46.82 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  46.52 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  46.85 
 
 		 295 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  44.66 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  44.66 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  41.31 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  29.6 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  23.26 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.64 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  26.78 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 117 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  35.19 
 
 		 104 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  37.78 
 
 		 382 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 117 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  37.78 
 
 		 382 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.79 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 474 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  36.67 
 
 		 384 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  32.97 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  28.49 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  26.2 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.11 
 
 		 388 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  27.54 
 
 		 284 aa  42  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>