75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2730 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  48.12 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  44.6 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  49.65 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  49.65 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  48.94 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  48.72 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  43.24 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  41.21 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  44.81 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  43.66 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  45.77 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  44.59 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  46.67 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  45.9 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  45.19 
 
 		 161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  46.28 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  46.15 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  41.43 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  41.43 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  43.38 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  43.38 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  43.38 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  46.34 
 
 		 165 aa  97.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  43.59 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  44.72 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  42.65 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.58 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  28.74 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.58 
 
 		 286 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6353  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.67 
 
 		 731 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  31.96 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  35.9 
 
 		 738 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  42.19 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  31.06 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  34.07 
 
 		 266 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  34.09 
 
 		 266 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  40.62 
 
 		 350 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  30 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.67 
 
 		 308 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 546 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  40 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.61 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.33 
 
 		 312 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.77 
 
 		 339 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 217 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.77 
 
 		 339 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  36.71 
 
 		 390 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  36.99 
 
 		 517 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  27.67 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 		 418 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  30.56 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 		 418 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  24.73 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  40.98 
 
 		 707 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  32.79 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  31.94 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  31.19 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0097  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.340864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>