38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2485 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  100 
 
 		 161 aa  336  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  95.65 
 
 		 175 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  73.25 
 
 		 159 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  70.15 
 
 		 159 aa  211  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  61.15 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  69.13 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  68.99 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  51.59 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  57.03 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  51.63 
 
 		 145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  51.63 
 
 		 145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  46.84 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  50.68 
 
 		 140 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  51.37 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  47.65 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  50.68 
 
 		 140 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  48.97 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  48.97 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  48.97 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  51.11 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  45.39 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  47.41 
 
 		 144 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  49.24 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  48.46 
 
 		 142 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  43.37 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  42.28 
 
 		 224 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  43.95 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.16 
 
 		 726 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  30.21 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  26.03 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  28.8 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  31.58 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.02 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.02 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  33.01 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.69 
 
 		 293 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  31.19 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.62 
 
 		 286 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>