46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1538 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  97.14 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  79.31 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  60.74 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  66.96 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  56.03 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  61.54 
 
 		 139 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  56.03 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  60.34 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  48.37 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  56.82 
 
 		 224 aa  150  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  51.72 
 
 		 162 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  57.26 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  52.63 
 
 		 159 aa  146  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  53.08 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  53.08 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  53.08 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  51.11 
 
 		 161 aa  136  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  51.06 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  50.38 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  50 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  48.2 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  50.43 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  45.03 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  49.65 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  40.32 
 
 		 169 aa  94.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.1 
 
 		 726 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  30.95 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 393 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 		 738 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  32.63 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.03 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30.17 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30.17 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  28.45 
 
 		 394 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.36 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  25.69 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>