36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2663 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  56.82 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  56.82 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  56.82 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  58.47 
 
 		 142 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  57.14 
 
 		 165 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  59.02 
 
 		 144 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  53.96 
 
 		 139 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  48.92 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  54.24 
 
 		 146 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  51.54 
 
 		 142 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  46.04 
 
 		 146 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  52.27 
 
 		 145 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  52.27 
 
 		 145 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  46.53 
 
 		 159 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 149 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  42.24 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  46.58 
 
 		 162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  42.95 
 
 		 159 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  49.22 
 
 		 153 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  49.22 
 
 		 153 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  45.21 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  49.22 
 
 		 161 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  43.61 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  43.7 
 
 		 161 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  44.81 
 
 		 148 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  29.77 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.66 
 
 		 726 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  29.63 
 
 		 112 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.96 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  39.68 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.56 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.56 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  31.46 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>