40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2411 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  76.69 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  75.94 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  75.94 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  61.94 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  66.09 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  58.57 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  58.57 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  60.68 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  56.49 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  45.22 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  55.17 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  53.85 
 
 		 165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  47.37 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  49.66 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  51.52 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  51.52 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  51.52 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  44.03 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  46.26 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  46.56 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  43.87 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  47.41 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  47.73 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  46.88 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  44.52 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  34.68 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  32.14 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  35.9 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  26.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 546 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 		 738 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.66 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  31.46 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  35.21 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.36 
 
 		 707 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>