38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1777 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  100 
 
 		 159 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  80.58 
 
 		 175 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  79.39 
 
 		 161 aa  227  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  70.68 
 
 		 159 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  61.39 
 
 		 164 aa  206  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  70.77 
 
 		 162 aa  201  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  63.82 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  51.57 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  58.78 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  50.98 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  52.78 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  52.78 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  50.33 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  50.33 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  53.24 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  46.41 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  50.38 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  50.38 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  50.38 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  50.74 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  52.63 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  48.12 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  48.89 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  46.21 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  42.95 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  43.75 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.36 
 
 		 726 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  32.26 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  27.91 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  27.91 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  27.91 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.91 
 
 		 447 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  27.69 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 738 aa  40.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.97 
 
 		 286 aa  40.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>