51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4871 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  97.14 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  97.14 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  80.17 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  61.48 
 
 		 142 aa  174  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  66.96 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  56.03 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  61.54 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  56.03 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  60.34 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  58.97 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  56.82 
 
 		 224 aa  150  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  47.71 
 
 		 164 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  51.72 
 
 		 162 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  51.88 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  53.08 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  53.08 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  53.08 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  51.85 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  50 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  50.38 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  51.06 
 
 		 175 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  47.48 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  51.28 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  45.7 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  48.94 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  41.13 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 546 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  30.95 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  30.11 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 		 738 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  30.17 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  30.17 
 
 		 393 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29.31 
 
 		 394 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  26.61 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.31 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  30.1 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29.31 
 
 		 394 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 111 aa  42  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  28.74 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.67 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  32.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.67 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.67 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.67 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 388 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 388 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>