40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3622 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  60.71 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  60.71 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  60.71 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  65.79 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  61.54 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  57.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  57.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  55.47 
 
 		 224 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  53.85 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  57.02 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  46 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  48.95 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  53.91 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  53.91 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  53.91 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  53.45 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  47.73 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  48.63 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  50.4 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  47.48 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  47.92 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  46.67 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  47.41 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  43.05 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  42.86 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  33.87 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.97 
 
 		 286 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.61 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  34.57 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 738 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  31.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.68 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 		 705 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 284 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  25.51 
 
 		 249 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  25.25 
 
 		 151 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>