41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0736 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  100 
 
 		 173 aa  362  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  70.29 
 
 		 175 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  63.82 
 
 		 159 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  71.01 
 
 		 161 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  62.18 
 
 		 164 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  67.41 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  59.12 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  50.63 
 
 		 142 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  56.49 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  51.05 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  51.05 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  51.05 
 
 		 161 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  49.33 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  55.38 
 
 		 139 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  49.66 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  49.66 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  47.02 
 
 		 146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  52.27 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  45.7 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  45.03 
 
 		 140 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  45.03 
 
 		 140 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  48.51 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  46.97 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  45.21 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  45.04 
 
 		 144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  39.84 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  43.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  28.85 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  28.3 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  32.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 249 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 322 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  41.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  25.71 
 
 		 286 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.07 
 
 		 323 aa  40.8  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>