42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0691 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  343  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  62.02 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  60.83 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  57.85 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  52.45 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  56.2 
 
 		 140 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  56.2 
 
 		 140 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  52.55 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  52.55 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  60 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  57.02 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  54.78 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  43.84 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  49.32 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  49.34 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  52.38 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  48.89 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  52.38 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  47.79 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  46.48 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  47.74 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  47.83 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  47.83 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  44.79 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  45.19 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  34.13 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.7 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  39.08 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.26 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 546 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.03 
 
 		 726 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 388 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  23.76 
 
 		 151 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  27.16 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.94 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1219  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  26.75 
 
 		 343 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.983776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>