25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0342 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  100 
 
 		 114 aa  227  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  35.11 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  32.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  32.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  33.33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  35.9 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  40.98 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  30 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  25 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  25 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30 
 
 		 726 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  30.49 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 111 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  42.55 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 111 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 249 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  27.12 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  28.05 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  27.84 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>