74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3238 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  100 
 
 		 174 aa  356  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  40.72 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  39.52 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  43.45 
 
 		 280 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  41.76 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  41.76 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  41.76 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  40.12 
 
 		 209 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  44.68 
 
 		 260 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  40.59 
 
 		 260 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  40.52 
 
 		 379 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  42.04 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  42.76 
 
 		 257 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  43.05 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  38.06 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  43.45 
 
 		 373 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  38.27 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  35.5 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  35.12 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  33.53 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  37.91 
 
 		 293 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  38.56 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  38.62 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 382 aa  99.8  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  36.61 
 
 		 878 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  33.13 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  31.13 
 
 		 414 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.61 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  26.17 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30 
 
 		 631 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  30.93 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  31.63 
 
 		 209 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  27.21 
 
 		 296 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  35.8 
 
 		 629 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 702 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 702 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 647 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 657 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 647 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30 
 
 		 388 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30 
 
 		 388 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 636 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.4 
 
 		 642 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.33 
 
 		 640 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 320 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  29.7 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.07 
 
 		 653 aa  44.3  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.34 
 
 		 640 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  31.46 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30 
 
 		 632 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.43 
 
 		 632 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  28.41 
 
 		 339 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.07 
 
 		 642 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.27 
 
 		 329 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.07 
 
 		 642 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  29.29 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  28.46 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  31.4 
 
 		 664 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  30.59 
 
 		 652 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 393 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>