36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0474 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  42.57 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  46.62 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  42.86 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  47.06 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  47.29 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  43.75 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  37.25 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  41.13 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  40.32 
 
 		 140 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  40.32 
 
 		 140 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  40.32 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  36 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  38.3 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  34.68 
 
 		 142 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  32.26 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  32.26 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  34.13 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  33.87 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  35.2 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  36.43 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  31.01 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  30.26 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  31.69 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  30.94 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  29.38 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  27.88 
 
 		 293 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.95 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  25.81 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.33 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  35.9 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  27.08 
 
 		 112 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  33.8 
 
 		 483 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>