123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1874 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  32.16 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  33.02 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  34.75 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  24.76 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  30.59 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  26.32 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  34.15 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  32.52 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  29.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  29.81 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  29.81 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  29.81 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  26.61 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  32.79 
 
 		 171 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 395 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  24.34 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29.73 
 
 		 394 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29.73 
 
 		 394 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  27.1 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  28.7 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 393 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 394 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.45 
 
 		 394 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 101 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  28 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  28.83 
 
 		 393 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  34.09 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 647 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.52 
 
 		 707 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  32.58 
 
 		 352 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 647 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.33 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 636 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  22.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  28.41 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.71 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  30.95 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  30.53 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  38.04 
 
 		 664 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  26.37 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  27.03 
 
 		 393 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  29.76 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 631 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.42 
 
 		 653 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.16 
 
 		 702 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.16 
 
 		 702 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 388 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3734  hypothetical protein  33.68 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  31.37 
 
 		 119 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  29.47 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.68 
 
 		 632 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1909  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  31.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  28.04 
 
 		 477 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  26.61 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  33 
 
 		 683 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  31.46 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.14 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.29 
 
 		 632 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  26.27 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.87 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  31.11 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  23.81 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  26.15 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.15 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>