111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0885 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 546 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  34 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  34 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  33.88 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  32.61 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  31.4 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 702 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 702 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  30.93 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  32.29 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30.85 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  36.9 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  27 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  27 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  33.87 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  28.16 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.72 
 
 		 394 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.72 
 
 		 394 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  31.31 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.31 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  30.39 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  27 
 
 		 393 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  30.53 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  32.35 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  30.68 
 
 		 414 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  30.95 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  29.79 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 414 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.12 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.19 
 
 		 642 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  35.16 
 
 		 643 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  31.87 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  27.59 
 
 		 373 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  30.3 
 
 		 398 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  32.5 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 644 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  34.41 
 
 		 640 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.61 
 
 		 339 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  34.41 
 
 		 640 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  32.04 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  32.93 
 
 		 878 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  34.41 
 
 		 642 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  34.41 
 
 		 642 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.93 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  28.72 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.7 
 
 		 632 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.56 
 
 		 649 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  31.4 
 
 		 556 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  26.04 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  28.45 
 
 		 260 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 260 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  30.93 
 
 		 254 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  35.23 
 
 		 632 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 683 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  25.51 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  25.51 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  26.32 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  26.32 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30.53 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  32.11 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 124 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  27.85 
 
 		 97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  27.85 
 
 		 97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>