45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0708 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  92.35 
 
 		 206 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  89.6 
 
 		 212 aa  327  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  47.78 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  46.96 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  47.67 
 
 		 280 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  45.93 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  47.77 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  47.77 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  47.77 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  47.02 
 
 		 260 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  42.94 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  37.76 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  42.08 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  39.43 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  38.42 
 
 		 215 aa  120  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  36.26 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  39.33 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  38.69 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  32.66 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 379 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  34.01 
 
 		 170 aa  94.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  36.69 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 382 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  35.57 
 
 		 373 aa  91.3  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  31.55 
 
 		 414 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  29.45 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  29.63 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  23.31 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.04 
 
 		 653 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  32.84 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  27.27 
 
 		 878 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  29.23 
 
 		 395 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 393 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 393 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 128 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25 
 
 		 546 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.31 
 
 		 640 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>