33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1944 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  58.95 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  47.78 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  50 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  48.3 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  42.63 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  42.7 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  40.76 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  40.76 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  43.53 
 
 		 280 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  45.57 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  43.23 
 
 		 257 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  42.48 
 
 		 260 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  35.14 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  35.47 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  33.53 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  34.13 
 
 		 373 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  32.8 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  34.64 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 293 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 379 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  32.68 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  30.52 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  28.07 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  23.4 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  26.79 
 
 		 878 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.35 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>