46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1593 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  87.74 
 
 		 206 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  83.96 
 
 		 197 aa  362  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  48.33 
 
 		 191 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  45 
 
 		 186 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  47.67 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  43.45 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  46.26 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  41.76 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  36.65 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  36.98 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  37.13 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  35.68 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  38.41 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  34.72 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  33.14 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  33.56 
 
 		 379 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 382 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  36.18 
 
 		 373 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  34.01 
 
 		 170 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  29.76 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  30.14 
 
 		 414 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  28.21 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.72 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  21.8 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  31.19 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  28.28 
 
 		 878 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.81 
 
 		 653 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.07 
 
 		 640 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  27.84 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.3 
 
 		 640 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  26.26 
 
 		 643 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  27.45 
 
 		 649 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  30.1 
 
 		 642 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  30.1 
 
 		 642 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  27.64 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.8 
 
 		 394 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>