36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4637 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  92.23 
 
 		 206 aa  387  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  46.99 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  44.92 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  40.89 
 
 		 259 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  40.89 
 
 		 259 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  40.89 
 
 		 259 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  45.5 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 260 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  46.34 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  40.76 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  43.64 
 
 		 186 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  43.68 
 
 		 215 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  37.76 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  36.57 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  40.72 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  38.01 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  39 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  37.02 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  42.76 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  34.41 
 
 		 373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  33.87 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  36.41 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 382 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 414 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  34.25 
 
 		 414 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  25.66 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  33.66 
 
 		 878 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  26.37 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  33.33 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  28.16 
 
 		 640 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 254 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.9 
 
 		 209 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>