44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2260 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  45.81 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  46.86 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  44.97 
 
 		 280 aa  157  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  49.68 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  42.19 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  42.19 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  42.19 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  41.09 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  43.09 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  38.74 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  43.64 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  41.8 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  43.2 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  37.5 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  38.42 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  37.13 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  35.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  41.22 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  37.97 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  34.33 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  40.26 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  37.28 
 
 		 379 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  37.99 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.54 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  38.19 
 
 		 382 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  33.16 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  30.49 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  31.91 
 
 		 414 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  32.61 
 
 		 878 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  26.24 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  31.68 
 
 		 640 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  25 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  31.46 
 
 		 643 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.87 
 
 		 642 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  30.69 
 
 		 640 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.78 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.59 
 
 		 653 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  26.97 
 
 		 339 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>