58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2733 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  100 
 
 		 170 aa  353  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  43.79 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  39.88 
 
 		 212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  43.21 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  38.37 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  41.36 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  38.69 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  40.12 
 
 		 206 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  41.42 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  37.42 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  35.29 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  36.2 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  41.01 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  35.58 
 
 		 260 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  36.65 
 
 		 260 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 293 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  32.5 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  32.08 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  36.43 
 
 		 257 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  31.25 
 
 		 206 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 382 aa  94  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  29.45 
 
 		 379 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 414 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  30.28 
 
 		 414 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  29.87 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  34.12 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  34.04 
 
 		 878 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  26.32 
 
 		 631 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.13 
 
 		 652 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  35.79 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  30 
 
 		 633 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.38 
 
 		 632 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.69 
 
 		 642 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  26.61 
 
 		 629 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 702 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 647 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 702 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 320 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  26.19 
 
 		 636 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  26.19 
 
 		 647 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 395 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.28 
 
 		 640 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  30.38 
 
 		 632 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 657 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  30.28 
 
 		 640 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 166 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  26.13 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  29.89 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 296 aa  41.2  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  27.71 
 
 		 645 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.58 
 
 		 653 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>