More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2793 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  100 
 
 		 379 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  44.63 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  36.27 
 
 		 878 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  37.66 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 205 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  34 
 
 		 206 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  35.8 
 
 		 260 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  35.62 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  40 
 
 		 174 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  38.06 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  34.39 
 
 		 257 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  36.6 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  41.11 
 
 		 224 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.06 
 
 		 208 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  36.63 
 
 		 191 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  39.26 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  36.31 
 
 		 234 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  34.05 
 
 		 206 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  34.05 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  33.97 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 186 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  38.12 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  34.05 
 
 		 197 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.5 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  32.99 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.09 
 
 		 213 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 219 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 203 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  32.94 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  32.94 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  34.21 
 
 		 242 aa  99.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  34.08 
 
 		 217 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  34.08 
 
 		 219 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.57 
 
 		 221 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  33.89 
 
 		 220 aa  99.4  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.94 
 
 		 209 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 212 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.67 
 
 		 208 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.67 
 
 		 208 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 222 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.3 
 
 		 208 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 208 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  37.65 
 
 		 215 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.72 
 
 		 208 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 208 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 208 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.16 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 206 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  29.69 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  29.69 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 209 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 202 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  31.95 
 
 		 196 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  31.95 
 
 		 201 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 217 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  30.81 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 238 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  33.7 
 
 		 271 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  35.5 
 
 		 226 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  30.81 
 
 		 243 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.02 
 
 		 205 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32 
 
 		 255 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 200 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  34.84 
 
 		 219 aa  90.1  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 269 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.9 
 
 		 237 aa  90.5  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  32.16 
 
 		 230 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  32.16 
 
 		 230 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  28.48 
 
 		 170 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  31.58 
 
 		 217 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.39 
 
 		 203 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 211 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  37.85 
 
 		 207 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  31.38 
 
 		 216 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 205 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  31.55 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  34.36 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 205 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 201 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  32.37 
 
 		 204 aa  87.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 239 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  32.14 
 
 		 235 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 265 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 206 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 265 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 206 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>