More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003031 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  100 
 
 		 203 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  52.53 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  49.01 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  47.22 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  44.69 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  45.25 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  44.69 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  39.6 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  44.69 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  44.69 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  39.11 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  39.11 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  39.7 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  38.61 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  40.93 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  42.37 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  42.53 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  42.94 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  42.05 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.55 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  43.68 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  43.68 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  37.89 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  39.9 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  40 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 256 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.51 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.84 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.88 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.54 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.02 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  38.42 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  42.94 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.56 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.52 
 
 		 318 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  36.1 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.02 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.3 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  33.14 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  36.65 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.2 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  37.02 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  37.71 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.59 
 
 		 255 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.25 
 
 		 240 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  32.8 
 
 		 246 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  31.38 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 236 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  34.25 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  35.94 
 
 		 257 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  35 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.59 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  35.06 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 265 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  32.62 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 265 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.06 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  33.69 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.36 
 
 		 265 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  32.57 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  34.66 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  35.45 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  35.26 
 
 		 238 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  32.02 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  34.08 
 
 		 229 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  35.26 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  34.08 
 
 		 229 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  35.26 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>