More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0772 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  100 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  86.44 
 
 
225 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  79.33 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  77.66 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  71.75 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  67.7 
 
 
222 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  75.71 
 
 
255 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  74.05 
 
 
212 aa  285  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  73.51 
 
 
212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  70 
 
 
205 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  69.83 
 
 
209 aa  265  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  60.43 
 
 
217 aa  224  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  58.29 
 
 
217 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  59.36 
 
 
217 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  59.36 
 
 
217 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  59.36 
 
 
217 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  59.36 
 
 
217 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  57.07 
 
 
217 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  51.79 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  51.09 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  58.29 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  58.29 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
215 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
206 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
206 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
206 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
265 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  56.76 
 
 
265 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  57.07 
 
 
545 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  55.21 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  55.21 
 
 
219 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  51.6 
 
 
219 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  50.81 
 
 
219 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  50.8 
 
 
238 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  51.56 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  46.54 
 
 
220 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  48.66 
 
 
246 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  51.87 
 
 
211 aa  191  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  49.19 
 
 
209 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  49.43 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  46.07 
 
 
207 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  46.63 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  46.63 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  43.38 
 
 
200 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  46.11 
 
 
205 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  46.43 
 
 
207 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  48.24 
 
 
201 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  48.24 
 
 
196 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  47.67 
 
 
201 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  46.93 
 
 
210 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  45.81 
 
 
205 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  44.04 
 
 
205 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  46.89 
 
 
229 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  39.56 
 
 
209 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  47.09 
 
 
203 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  42.64 
 
 
207 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  43.15 
 
 
207 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  43.15 
 
 
207 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  43.15 
 
 
207 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  41.62 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.86 
 
 
205 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  43.43 
 
 
206 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  41.62 
 
 
207 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  41.62 
 
 
207 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  41.62 
 
 
207 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  41.62 
 
 
207 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  44.51 
 
 
318 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  43.5 
 
 
205 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.5 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  41.62 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  43.75 
 
 
223 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.07 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  41.81 
 
 
205 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  39.91 
 
 
227 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  38.58 
 
 
206 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.88 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  40.94 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  39.64 
 
 
202 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  40.35 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  38.07 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  38.61 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  40.56 
 
 
213 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.04 
 
 
206 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  38.1 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  42.44 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  38.34 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  39.18 
 
 
219 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  38.27 
 
 
205 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  39.18 
 
 
217 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
227 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  39.66 
 
 
205 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  35.33 
 
 
214 aa  121  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  35.33 
 
 
266 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.02 
 
 
260 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.02 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  35.59 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  34.94 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  38.55 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>