More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0082 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  100 
 
 
238 aa  487  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  79.27 
 
 
246 aa  384  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  59.36 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  57.3 
 
 
219 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  54.59 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  51.6 
 
 
219 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  54.59 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  50 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  51.14 
 
 
219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  53.77 
 
 
205 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  53.51 
 
 
225 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  52.82 
 
 
219 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  54.59 
 
 
217 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  52.74 
 
 
242 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  50.81 
 
 
223 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  52.72 
 
 
255 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  54.91 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  54.91 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  48.65 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  51.87 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  55.49 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  51.85 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  55.49 
 
 
217 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
215 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  54.97 
 
 
545 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
206 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
206 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  54.91 
 
 
217 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  54.97 
 
 
206 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  54.91 
 
 
217 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  54.91 
 
 
217 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  48.79 
 
 
219 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  52.87 
 
 
212 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  52.87 
 
 
212 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  46.11 
 
 
211 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  50.9 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  46.74 
 
 
220 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  48.85 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  44.44 
 
 
207 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  46.93 
 
 
205 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  46.43 
 
 
318 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  45.3 
 
 
201 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  42.6 
 
 
209 aa  148  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  45.03 
 
 
200 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  43.92 
 
 
207 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  40.09 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  44.44 
 
 
200 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  44.92 
 
 
229 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  40.09 
 
 
205 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  40.36 
 
 
205 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  40.36 
 
 
205 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  40.57 
 
 
205 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  41.14 
 
 
205 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  41.24 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  41.24 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  40.68 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  40.11 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  40.11 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  40.11 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  40.11 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  39.55 
 
 
207 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  43.53 
 
 
202 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
200 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.68 
 
 
206 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  41.07 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.77 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  39.39 
 
 
196 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  39.39 
 
 
201 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  39.43 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  38.62 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.72 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.86 
 
 
205 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  36.41 
 
 
266 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  38.5 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  38.3 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.77 
 
 
213 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  37.97 
 
 
206 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  36.87 
 
 
252 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  34.47 
 
 
221 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  36.53 
 
 
202 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  36.92 
 
 
205 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  40.23 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  37.28 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  40.23 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  37.44 
 
 
210 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  36.9 
 
 
206 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  37.11 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  34.72 
 
 
214 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  35.1 
 
 
222 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  35.63 
 
 
227 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  34.13 
 
 
222 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.39 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.48 
 
 
217 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  37.28 
 
 
217 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  37.28 
 
 
219 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.97 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>