More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1068 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  100 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.84 
 
 		 318 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  37.44 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  36.54 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  36.41 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  36.6 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.59 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  56.18 
 
 		 106 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  59.3 
 
 		 109 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.92 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  35.35 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  35.75 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  31.96 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  35.48 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.92 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  59.52 
 
 		 111 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  31.14 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.36 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 379 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.3 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  37.42 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  35.43 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  34.67 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.88 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  34.24 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  29.5 
 
 		 191 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  53.16 
 
 		 112 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  36.02 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.17 
 
 		 265 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  33.33 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.26 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.32 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.32 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.32 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.32 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  34.08 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.53 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 168 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 256 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  32.46 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  35.54 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.57 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  32.99 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.29 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  35.98 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  39.56 
 
 		 91 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 265 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 265 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  32.38 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  32.47 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.38 
 
 		 545 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  31.9 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  31.9 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  32.55 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.18 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  32.52 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  32.52 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  32.52 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 108 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  30.85 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  32.49 
 
 		 271 aa  85.5  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  36.31 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  36.31 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.84 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.5 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.76 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  35.33 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  33.88 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.75 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.55 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 113 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  29.72 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.99 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.5 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.5 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  44.93 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  34.73 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.73 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.5 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>