More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0312 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  72.97 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  69.19 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  39.66 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.64 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  35.37 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  34.13 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50.55 
 
 		 108 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.98 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.03 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  50.57 
 
 		 98 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  37.87 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  34.24 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  33.5 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  35.76 
 
 		 218 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  32.52 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  32.42 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  33.51 
 
 		 266 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.15 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  31.5 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.34 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  34.41 
 
 		 219 aa  91.3  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 219 aa  91.3  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.76 
 
 		 256 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.2 
 
 		 213 aa  90.9  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  32.4 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.5 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 292 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  32.4 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  33.95 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.33 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.93 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  32.65 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.84 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  32.45 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  34.32 
 
 		 225 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  30.15 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  32.14 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  30 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.18 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  31.67 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.07 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  32.99 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.43 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  30.46 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  32.5 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  31.5 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  29.56 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  29.56 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  34.03 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  31.67 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  31.67 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  35.14 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.68 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  30.15 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.02 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  32.14 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  35 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  33.5 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  30.1 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  31.72 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>