More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3745 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  100 
 
 
545 aa  1104    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  96.98 
 
 
265 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  100 
 
 
215 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  99.51 
 
 
206 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  99.51 
 
 
206 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  99.51 
 
 
206 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  82.95 
 
 
217 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  83.41 
 
 
217 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  83.41 
 
 
217 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  83.41 
 
 
217 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  82.11 
 
 
217 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  81.57 
 
 
217 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  81.57 
 
 
217 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  72.02 
 
 
217 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  71.56 
 
 
217 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  71.1 
 
 
217 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  60.54 
 
 
205 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  50.45 
 
 
219 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  58.24 
 
 
225 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  50.22 
 
 
219 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  56.59 
 
 
223 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  49.55 
 
 
219 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  54.59 
 
 
209 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  54.35 
 
 
212 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  54.05 
 
 
209 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  56.04 
 
 
255 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  52.17 
 
 
220 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  47.84 
 
 
242 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  48.21 
 
 
219 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  52.6 
 
 
222 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  50.25 
 
 
211 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  54.97 
 
 
238 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  53.8 
 
 
246 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  53.72 
 
 
219 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  52.69 
 
 
208 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  50.52 
 
 
219 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  53.76 
 
 
212 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  53.23 
 
 
212 aa  181  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  47.03 
 
 
207 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  47.12 
 
 
207 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  47.03 
 
 
205 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  48.04 
 
 
210 aa  156  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  41.74 
 
 
229 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  42.79 
 
 
209 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  43.18 
 
 
205 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  43.64 
 
 
205 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  43.64 
 
 
205 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  44.07 
 
 
207 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  44.07 
 
 
207 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  44.07 
 
 
207 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  43.64 
 
 
205 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  44.07 
 
 
207 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  39.83 
 
 
227 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  44.63 
 
 
207 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  44.63 
 
 
207 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  44.63 
 
 
207 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  42.86 
 
 
205 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  42.71 
 
 
205 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  46.02 
 
 
201 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
207 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  42.94 
 
 
207 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  44.32 
 
 
201 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  44.32 
 
 
196 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.9 
 
 
200 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
206 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  43.46 
 
 
206 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  38.74 
 
 
207 aa  144  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  45.51 
 
 
203 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
206 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  42.11 
 
 
223 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.89 
 
 
205 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
318 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  38.46 
 
 
206 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  41.58 
 
 
205 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.39 
 
 
206 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
206 aa  133  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  40.31 
 
 
215 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  40.68 
 
 
200 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  40.68 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  40.91 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  40.91 
 
 
260 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.47 
 
 
205 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
205 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  36.19 
 
 
212 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  42.37 
 
 
202 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  38.61 
 
 
222 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  39.49 
 
 
206 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  37.62 
 
 
222 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  37.14 
 
 
202 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  38.22 
 
 
218 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  37.91 
 
 
200 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  36.7 
 
 
214 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  35.06 
 
 
221 aa  123  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  40.86 
 
 
213 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  36.9 
 
 
266 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  38.76 
 
 
219 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  37.37 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  38.76 
 
 
217 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>