More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5446 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  73.62 
 
 		 188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.3 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.96 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  35.42 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.75 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 179 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 292 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  33.76 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 236 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 219 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 219 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  35.22 
 
 		 219 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  32.5 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  35 
 
 		 229 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  35 
 
 		 229 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  32.95 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  32.95 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  32.95 
 
 		 249 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  32.95 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  34.9 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  35 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  32.95 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  35 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  32.95 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  37.35 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  35 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  32.95 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  30.37 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  35.14 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  35.36 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  31.34 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.91 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  34.81 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  35.15 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.53 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  27.07 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  34.57 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  28.78 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  34.41 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  31.25 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  28.43 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.91 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  32.28 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32.54 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  32.39 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  34.59 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  34.59 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  34.59 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  28.8 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.71 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  33.15 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 265 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 265 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  32.6 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  30.94 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  29.44 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  32.78 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  32.6 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  29.7 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.78 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.19 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  30.53 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  30.48 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  33.91 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  33.91 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>