More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6402 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  61.11 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  60.65 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  60.65 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  56.88 
 
 		 218 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  57.94 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  49.08 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  50.25 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  43.58 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  42.99 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  49.01 
 
 		 168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  37.42 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.42 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.99 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.11 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.26 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.91 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  37.29 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40.68 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  38.65 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  36.87 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  37.71 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  37.99 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  37.99 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  37.71 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  37.99 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.16 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.43 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.16 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.2 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.43 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.59 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.65 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35.03 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  38.29 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  37.84 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  34.39 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  36.79 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  39.88 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  39.88 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.88 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  38.67 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.03 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  39.66 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  36.53 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  34.9 
 
 		 382 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.09 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  37.21 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.53 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.4 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  36.63 
 
 		 243 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 236 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 254 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 239 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 254 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  35.33 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.33 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  34.68 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.12 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>