More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3546 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  63.84 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  57.5 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  62.57 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  57.5 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  57.5 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  61.8 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  56.72 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  57 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  60.67 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  55.88 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  61.24 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  47.22 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  44.81 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  44.25 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  44.63 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  44.63 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  40.96 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  44.63 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  44.07 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  43.5 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  37.23 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.57 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.71 
 
 		 318 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.07 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  36.87 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  36.87 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  40.72 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.59 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.52 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.75 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  35.75 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.8 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.68 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  34.91 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  35.33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  38.29 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.68 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  34.44 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  30.8 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.29 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.29 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.29 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.79 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  39.43 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.29 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.29 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.29 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  37.71 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.29 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  33.89 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.24 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  41.92 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.12 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  33.5 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.32 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.14 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.87 
 
 		 271 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  33.88 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  36 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  34.6 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  36.63 
 
 		 284 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  37.71 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  32.02 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  32.02 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  35.43 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  32.02 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  33.53 
 
 		 246 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30.22 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>