More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1477 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  46.39 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  44.44 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  44.25 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  40.93 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  37.78 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  37.78 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  37.78 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  38.18 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  38.18 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  38.18 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  44.94 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  41.95 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  44.83 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  42.26 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  41.14 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  41.95 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  42.66 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  39.44 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  36.92 
 
 		 243 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  44.57 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  40.4 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  44.63 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  36.82 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  40.33 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  38.12 
 
 		 208 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40.21 
 
 		 318 aa  131  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.98 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  41.86 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.28 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  37.95 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.28 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  39.9 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  39.11 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  40.7 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  39.77 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  36.41 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  41.32 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  36.89 
 
 		 253 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  37.57 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.04 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.98 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  36.46 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  36.92 
 
 		 257 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  37 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.93 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  40.94 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.36 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  38.37 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  39.53 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  34.98 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.76 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.32 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.23 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  38.37 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  38.37 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  38.37 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  38.64 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.83 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  40.12 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  37.79 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.57 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  33.5 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  37.93 
 
 		 545 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  40.7 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  36.63 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  36.76 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>