More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2741 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  57.94 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  53.99 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  51.87 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  52.34 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  52.34 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  48.15 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  48.15 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  48.15 
 
 		 223 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 292 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  41.2 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  43.33 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.85 
 
 		 188 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.74 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  35.22 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.59 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  34.15 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  36.99 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  36.99 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  37.28 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.63 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  34.71 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  34.71 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  35.2 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.1 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.39 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.93 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  34.09 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.05 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.83 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.86 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  36.16 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.95 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 267 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.66 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  35.29 
 
 		 243 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  29.95 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.09 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.06 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.38 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.47 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  33.53 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.95 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  34.11 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  34.11 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  32.76 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.57 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.12 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.12 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.12 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  37.65 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.12 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.12 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  31.67 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.12 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.12 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  37.79 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  34.52 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>